Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHMP4AQ9BY43 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms