Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms