Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIRIP3Q9BW71 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIRIP3Q9BW71 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms