Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf16Q9BUW7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C9orf16Q9BUW7 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms