Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDC1Q9BTX1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms