Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HDHD3Q9BSH5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HDHD3Q9BSH5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms