Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SEC22CQ9BRL7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms