Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MESP1Q9BRJ9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms