Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LPIN3Q9BQK8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LPIN3Q9BQK8 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms