Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD5Q99666 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms