Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC38A3Q99624 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms