Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUP88Q99567 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP88Q99567 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms