Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRBNQ96SW2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRBNQ96SW2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms