Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRAMP1Q96RY5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms