Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAM1Q96QH2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAM1Q96QH2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms