Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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