Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COG3Q96JB2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms