Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RNF185Q96GF1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms