Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
RNFT2Q96EX2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms