Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
OTUB2Q96DC9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
OTUB2Q96DC9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms