Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FAF2Q96CS3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FAF2Q96CS3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms