Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TM4SF18Q96CE8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TM4SF18Q96CE8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms