Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RUNDC1Q96C34 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RUNDC1Q96C34 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms