Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SMARCC1Q92922 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCC1Q92922 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCC1Q92922 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCC1Q92922 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCC1Q92922 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCC1Q92922 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCC1Q92922 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMARCC1Q92922 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms