Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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GCN1Q92616 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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GCN1Q92616 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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GCN1Q92616 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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GCN1Q92616 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GCN1Q92616 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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