Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TOPBP1Q92547 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TOPBP1Q92547 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms