Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RGP1Q92546 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms