Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RUFY2Q8WXA3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms