Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FNDC9Q8TBE3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms