Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA6DQ8NFY4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA6DQ8NFY4 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms