Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms