Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CHCHD4Q8N4Q1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHCHD4Q8N4Q1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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