Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SYT9Q86SS6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms