Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KNDC1Q76NI1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KNDC1Q76NI1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms