Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MED13LQ71F56 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms