Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP50Q70EL3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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