Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BBS12Q6ZW61 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BBS12Q6ZW61 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms