Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVK1

TMEM179, Transmembrane protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM179Q6ZVK1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM179Q6ZVK1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM179Q6ZVK1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms