Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM43BQ6ZT52 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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