Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CAPN12Q6ZSI9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CAPN12Q6ZSI9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms