Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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CASC2Q6XLA1 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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