Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCBE1Q6UXH8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms