Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms