Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC171Q6TFL3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms