Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASC1Q6TDU7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms