Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TTC41PQ6P2S7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms