Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ANKRD54Q6NXT1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ANKRD54Q6NXT1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms