Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SDE2Q6IQ49 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms