Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CARMIL2Q6F5E8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms