Protein–RNA interactions for Protein: Q6B0B8

TIGD3, Tigger transposable element-derived protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD3Q6B0B8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TIGD3Q6B0B8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms